Bruno PEIFFER   vendredi 5 novembre 1999 19:13

>Bonjour
>
>Je suis étudiante en IUT Génie Biologique de Bourg en Bresse, et doit
>réaliser un dossier sur la MICROBIOLOGIE PREVISIONNELLE, pourriez-vous
>m'aider en me donnant, si vous les connaissez, les sites les plus
appropriés
>à ma recherche...
>
>Je vous remercie par avance.
>
>VERMEULEN Cécile.


Dans le monde anglophone j'ai sélectionné les sites suivants, par contre je n'ai pas trouvé grand chose dans le monde francophone.

http://www.cdc.gov/ncidod/eid/vol3no4/mcmeekin.htm

http://www.utas.edu.au/docs/agsci/PMC96/symabs.html

http://foodsci.rutgers.edu/schaffner/lab.html

Si d'autres personnes connaissent des sites intéressants traitant de microbiologie prévisionnelle, merci de nous transmettre les références.

Cordialement
B.P
index.html

Jean Cazals    vendredi 5 novembre 1999 19:49

Vous pouvez aller telecharger, sur internet, le programme PMPWIN version 5.1 de l'USDA,
Il est en anglais mais facile d'interpretation ("anglais d'aeroport", courbes et noms latins !)
L'adresse du site etait :http://www.fst.vt.edu/cfast/publications.html
Elle ne marche plus demander a :
Dr. R. L. Buchanan or Dr. R. C. Whiting
USDA/ARS Eastern Regional Research Center
Microbial Food Safety Research Unit
600 E. Mermaid Lane
Wyndmoor, PA  19038
Telephone:  (215) 233-6636 (RLB)
                 or (215) 233-6437 (RCW)
FAX:  (215) 233-6581
E-mail:  rbuchanan@arserrc.gov
         or rwhiting@arserrc.gov

Jean CAZALS

  vendredi 4 août 2000 00:15

Quelques liens concernant la microbiologie prévisionnelle
http://www.cdc.gov/ncidod/eid/vol3no4/mcmeekin.htm

http://www.utas.edu.au/docs/agsci/PMC96/symabs.html

http://foodsci.rutgers.edu/schaffner/lab.html

 Philippe Sommer  Tuesday, October 24, 2000 5:07 PM

Pour cause de Listeria, je m'intéresse de plus en plus à la microbiologie prévisionnelle (ou prédictive ? je ne sais pas). Est ce que certains membres de la liste pourraient m'indiquer des références d'ouvrages récents pour commencer dans ce domaine.
 
Merci d'avance
 
Philippe Sommer

  mardi 24 octobre 2000 23:58

Concernant la microbiologie prévisionnelle, voici quelques références.

Symposium "la microbiologie prévisionnelle appliquée à la conservation des aliments réfrigérés"

http://www.iaa-cornouaille.net/bibliotheque/symp98.html

Albert Amgar mercredi 25 octobre 2000 07:47

Les ouvrages et les colloques y compris celui récent de Louvain en Belgique en septembre 2000 ne manquent pas.
Je vous suggère pour commencer d'aller sur le site de l'université de Lyon pour voir quelques thèses au format pdf
(http://biomserv.univ-lyon1.fr/txtdoc/THESES/) réalisées sur le sujet et
notamment :
- Sandrine CHARLES-BAJARD (1996) : Modélisation à visée prévisionnelle de la cinétique de croissance d'une population de Listeria monocytogenes,
- Sophie BREAND (1998) : Etude biométrique de la réponse d'une population bactérienne à une variation défavorable de température ou de pH,
- Marie Laure DELIGNETTE-MULLER : Méthodes de prédiction des aptitudes de croissance des populations de micro-organismes

O. Cerf  jeudi 26 octobre 2000 10:21

Ce à quoi il est fait référence dans le message de Ph. Sommer (futures directives de l'UE pour Listeria) est probablement une allusion à une Opinion du comité scientifique de l'alimentation humaine, que je joins à ce message.

Microbiologie prévisionnelle ou prédictive ? En français, on utilise plutôt le mot prévision pour décrire une démarche raisonnée ou même scientifique (exemple : les prévisions météorologiques), et le mot prédiction pour une démarche moins rationnelle (exemple : les prédictions de Nostradamus). A vous de juger si la microbiologie quantitative est scientifique ou magique !

O. Cerf  mardi 14 novembre 2000 15:28

Pour Ph. Sommer : le CTSCCV, à Alfort, possède les comptes-rendus du colloque de microbiologie prévisionnelle de Louvain.

Alain GONTHIER jeudi 11 janvier 2001 17:02

Toutes les données utilisées en microbiologie prévisionnelle sont obtenues à la suite de contaminations expérimentales soit de milieux de culture soit de denrées alimentaires. Or, ces conditions de contaminations expérimentales sont différentes des conditions naturelles et pourraient donc entraîner des modifications des paramètres de croissance (latence, temps de génération).

Qu'en pensez-vous?

Existe-t-il des données biblio (ou autres) de croissance bactérienne à la suite de contaminations naturelles ou bien concernant la comparaison entre les 2 types de contamination.

Dans l'attente de vos réponses

DFromentier  vendredi 12 janvier 2001 08:24

J'ai justement une publication sous les yeux concernant ce sujet.

Dalgaard P. and Jorgensen L. V. (1998). Predicted and observed growth of Listeria monocytogenes in seafood challenge tests and in naturally contaminated cold-smoked salmon. International Journal of Food microbiology 40, 105-115.

Bonne journée à tous.

Didier FROMENTIER

O. Cerf  lundi 15 janvier 2001 15:19

Oui, vous avez raison. L'état physiologique des inoculum n'est pas pris en compte par les microbiologistes prévisionnistes. A priori on ne tient compte ni des conditions que allongent le temps de latence, ni de celles qui le raccourcissent. En langage de prévisionniste : "La modélisation du temps de latence est encore imparfaite".
Voici deux références :
Gay, M., Cerf, O. and Davey, K. R. (1996). Significance of pre-incubation temperature and inoculum concentration on subsequent growth of Listeria monocytogenes at 14°C. Journal of Applied Bacteriology 81, 433-438.
Gay, M. and Cerf, O. (1997). Significance of temperature and preincubation temperature on survival of Listeria monocytogenes at pH 4.8. Letters in applied Microbiology 25, 257-260.

Albert Amgar lundi 15 janvier 2001 16:05

Ces deux publications sont disponibles auprès d'ASEPT.
Si vous souhaitez recevoir un exemplaire, merci m''adresser vos coordonnées.





Françoise Goubin-Gramatica  lundi 16 juillet 2001 22:17

- Je cherche des références concernant les temps de génération des espèces bactériennes recherchées en microbiologie alimentaire, en fonction de la température. Il doit exister des données théoriques de croissance en milieu défini,
mais existe-t'il des données plus proches de la réalité des denrées alimentaires (incluant  pH, aw,..)? Je suis preneuse de quelques pistes, ne serait-ce que pour avoir dess données de base sur le sujet.

O. Cerf  mardi 17 juillet 2001 09:40

At 16/07/2001 22:17 +0200, you wrote:
>- Je cherche des références concernant les temps de génération des espèces
>bactériennes recherchées en microbiologie alimentaire, en fonction de la
>température.

Vous aurez des renseignements utiles, mais à manier avec bon sens, dans Pathogen Modeling Program, téléchargeable gratuitement à http://www.arserrc.gov/mfs/pathogen.htm. Température, pH, teneur en sel ou aw, et parfois nitrite, sont les facteurs pris en compte.

Pour répondre à une autre question sur la température des étuves, ce logiciel montre qu'une tolérance de 2°C ne change pas grand chose à la
probabilité de voir une colonie sur milieu gélosé après un temps d'incubation "approprié", si les bactéries n'ont pas subi un traitement qui retentit sur leur temps de latence. Pour tenir compte de cette dernière possibilité,  les temps "appropriés" comportent une marge de sécurité. Mais ceux qui font de la microbiologie prévisionnelle et ceux qui font des analyses d'aliments ne sont en général pas les mêmes personnes. Surtout, au moment où la plupart des normes ont été rédigées, la microbiologie prévisionnelle était encore peu connue. Conclusion, lorsque les normes seront révisées, il sera utile d'inviter des microbiologistes prévisionnels à participer à la réflexion !

Concernant maintenant les micro-organismes à prendre en compte pour le calcul de le VP, la réponse de Ph. Sommer est la bonne. Il faut avoir conscience que les spores bactériennes sont peu ou pas affectées par la cuisson des plats cuisinés préparés à l'avance. C'est bien pour cette raison que la chaîne de froid s'impose.

mercredi 18 juillet 2001 22:51

Web site of Intuitive Systems, Inc., makers of VirtualUnknownT Microbiology, the most powerful microbiology computer simulation available. Click the biohazard symbol below for more information about VirtualUnknownT Microbiology, or press a button to the left for other information. And if you know where you need to go, check out the quick links list to the right of the biohazard symbol. Please address any comments/questions about this web site to webmaster@intuitiveinc.com
http://www.intuitiveinc.com/index.html

Bernard Tailliez  mercredi 27 février 2002 16:16

L'USDA ouvre un laboratoire "virtuel"

Pour visiter ce site :

http://www.arserrc.gov/cemmi/

marie dupont  vendredi 15 mars 2002 07:53

qu'est ce que la microbiologie prédictive est elle reconnue par les services officiels ?

Laurent Poisson  vendredi 15 mars 2002 10:28

Comme le signale le dernier numéro de "Process alimentaire" (Fev 2002) la microbiologie prédictive (ou prévisionnelle) consiste en une modélisation
mathématique du comportement des microorganismes en fonction de facteurs environnementaux comme le pH, l'aw, la température. Je ne pense pas pas que cet
outil, encore en developpement, soit reconnu.

marie dupont  vendredi 15 mars 2002 12:55

merci pour votre réponse
où puis je trouver des modèles de microbio prédictive ?

Laurent Poisson vendredi 15 mars 2002 14:10

Le mieux serait de prendre contact avec l'un des  laboratoires intéressés par cette thématique:
Institut pasteur de Lille, Michèle Viallette 03 20 87 78 53
ADRIA de Quimper, Dominique Thuault 02 98 10 18 10
Inra de Clermont-Ferrand, André Lebert 04 73 62 41 71

Loïc Meunier  vendredi 15 mars 2002 14:08

Vous pouvez relire l'avis de l'afssa sur la classification des aliments/listeria mono, des éléments de réponse récents s'y trouvent (outils
pmp6...). Certains sont accessibles par internet (dont pmp6, téléchargeable).

Anne-Laure Saint-Drenan  vendredi 15 mars 2002 17:20

Il est aussi possible d'y ajouter ASEPT.
Sur les modèles, une liste non exhaustive est présentée dans nos liens favoris : http://www.asept.fr/webs3.htm#previ

claire dericbourg mardi 4 juin 2002 09:57

Je réalise actuellement des tests de vieillissement et des challenge test sur des fromages à pate molle.

Sauriez vous ou je pourrais trouver des informations sur les température et pH max et min de croissance et
de survie des germes pathogènes (list mono, staph Aureus, salmonelles, E coli)

Je recherche également des données telles que le temps de génération de ces bactéries en fonction du pH et de
la température.

Philippe Sommer mardi 4 juin 2002 10:01

Il existe plusieurs solutions parallèles :

- vous trouverez sur Internet le logiciel PMPWIN en freeware qui pourra vous donner de telles informations,
- il existe un ouvrage de l'ICMSF (microorganims in Foods vol 5) edité par Blackie Academic & Professionnal
- les publications scientifiques

afilal  mardi 3 décembre 2002 15:07

Je cherche un protocole pour determiner les conditions optimums de croissance d'une bacterie isolée de poisson, les milieux de cultures à tester seront le bouillon nutritif et l'infusion du poisson en question, pour les parametres phisico chimiques (la T°, le pH, et la concentration en sel), par quoi commencer?

Philippe Sommer  mardi 3 décembre 2002 15:08

Le mieux pour ce type d'expérience multifactorielle surtout sur de la croissance bactérienne est d'utiliser des plans d'expériences, soit complets (mais cela suppose 2 puissance n expériences si vous avez deux niveaux par facteur) soit des plans tout préparés (Tagushi par exemple).

O. Cerf  vendredi 20 décembre 2002 22:28

At 2002-12-19 07:54 +0100, you wrote:
>Est-ce-que la microbiologie prévisionnelle utilise le challenge-test pour >la validation de ces modèles? Dans l'avenir, la microbiologie prévisionnelle devrait-elle remplacer le challenge-test ?

Futures définitions du Glossaire Hygiène des aliments, AFNOR NF V01 002 (2003):
Test de vieillissement microbiologique étude de l'évolution dans un aliment de populations de micro-organismes qui y sont habituellement présents, de façon détectable ou non

Test de croissance (ou « challenge test ») ou épreuve microbiologique étude de l'évolution de la population de micro-organismes ajoutés dans un aliment, comportant le dénombrement de la population initiale ajoutée 

NOTE         Les test de croissance sont utilisés plus particulièrement lorsque l'on étudie des micro-organismes pathogènes qui ne sont pas détectables de façon habituelle dans l'aliment.
Pour la microbiologie prévisionnelle, on peut utiliser aussi bien les observations de produits alimentaires "réels" par test de vieillissement, qu'ajouter des micro-organismes au produit pour un test de croissance. Des équations (des "modèles prévisionnels") sont ajustées sur les résultats des
dénombrements. Les paramètres des équations sont ensuite validés en refaisant d'autres tests.
Inversement, si l'on a confiance dans les équations, celles-ci peuvent être utilisées à la place de nouveaux tests. Ainsi on peut répondre à des questions comme celle-ci : pour le produit pour lequel les équations ont été établies, que se passe-t-il si l'on modifie la température, l'activité de l'eau ou la concentration en sel, ou le pH ?
Mais si on veut utiliser les équations pour des produits autres que ceux qui ont servi à établir les ces dernières, il sera prudent de faire quelques essais pou s'assurer qu'elles s'appliquent au produits étudiés..
Ces essais pourront être beaucoup moins lourds que ceux qui ont servi à établir les équations.

jeudi 10 juillet 2003 06:56

ARS USDA - Welcome to ComBase
ComBase is a relational database of Predictive Microbiology information.  ComBase contains thousands of data sets that describe the growth, survival and inactivation of bacteria under diverse environments relevant to food processing operations.
The data sets have been donated by researchers and institutions, and have been derived from the published literature.
http://wyndmoor.arserrc.gov/combase/

monique_thierry Sun, 13 Feb 2005 13:47:59 -0000

Je suis enseignant en bts bioanalyse (anciennement bts biochimiste).Dans le cadre de la rénovation de ce diplôme,nous sommes amenés à travailler sur la notion de challenge test.Quelqu'un pourrait-il m'indiquer ou je pourrais trouver un protocole (si possible normalisé)concernant cette technique
Merci

MERCREDI 08 JUIN 2005 

ARS USDA 07/06/05 Poultry Pathogen Models for Predictive Microbiology
http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/jun05/poultry0605.htm

MERCREDI 05 AVRIL 2006

FUTURA SCIENCES 04/04/06 Un modèle pour prédire l'évolution des populations de bactéries
http://www.futura-sciences.com/news-modele-predire-evolution-populations-bacteries_8507.php

Constant Depièreux Dimanche 3. Décembre 2006  7:53

L'université du Wisconsin à développé un modèle prédictif pour la croissance des pathogènes dans les produits à base de viande (Predicting Pathogen Growth for Your Process Using an Isothermal Based Prediction Tool (IBPT)).

Ci-joint une description par Dr. Steve Ingham, auteur de ce logiciel gratuitement disponible en ligne à l'adresse http://www.wisc.edu/foodsafety/meatresearch/ibm.htm :

"The Isothermal-Based Prediction Tool (IBPT) is used to predict whether Salmonella, Escherichia coli O157:H7, and Staphylococcus aureus will grow to a “level of concern” in raw beef and pork products. The model can be used in two types of situations. First, it can be used when a raw product is warming up. Examples of this situation are slow-cooking, thawing, or gradual warming during grinding, chopping, stuffing or other processing steps. The second situation is when a raw product is cooling. An example of this
situation would be the production of raw sausage from hot-boned pork.

What is the level of concern? The level of concern for Salmonella and E. coli O157:H7 is growth equal to one doubling; this level is based on USDA guidance that raw products should be handled so that these pathogens don’t grow. Because S. aureus only causes illness if it grows to high levels and produces toxin, the level of concern for S.
aureus is one doubling plus a ten-fold (1.0 log) increase. The IBPT is based on numerous experiments, each conducted at one temperature (isothermal), that determine a Critical Time (CT) that elapses before the level of concern is reached. "

DIMANCHE 11 NOVEMBRE 2007

Oléagineux, Corps Gras, Lipides. Volume 7, Numéro 5, Septembre – Octobre 2000
RECHERCHES Une expertise française en microbiologie prévisionnelle : le projet PREVIUS
http://www.john-libbey-eurotext.fr/fr/revues/agro_biotech/ocl/e-docs/00/03/36/9D/article.md

VENDREDI 04 JANVIER 2008

Predictive Microbiology Information Portal
http://portal.arserrc.gov/pmiphome.aspx

VENDREDI 22 AOUT 2008

BIOTRACER JUILLET 2008 Workshop title: Predictive modelling methodologies
and guidelines to data generators
http://www.biotracer.org/modellingdublin/

FOOD PRODUCTION 20/06/08 Forecast model can predict bacterial progeny, claim
researchers
http://www.foodproductiondaily.com/Quality-Safety/Forecast-model-can-predict-bacterial-progeny-claim-researchers

LUNDI 01 DECEMBRE 2008

L ACTUALITE POITOU CHARENTES N°54 - Au sommaire:
La microbiologie prédictive
http://www.scribd.com/doc/3248246/Biologie-Microbiologie-predictive

VENDREDI 16 JANVIER 2009

AFSSA ARCHIVES OUVERTES - 2006 - Mémoire en ligne : Modélisation
d'incertitudes et de variabilités en microbiologie quantitative des aliments
http://hal-afssa.archives-ouvertes.fr/view_by_stamp.php?&halsid=bvs7nc1mtfk45p1vvbr36o74a4&label=AFSSA&langue=fr&action_todo=view&id=tel-00345544&version=1&view=extended_view

MARDI 03 MARS 2009

ALIMENTAIRE PRO JANVIER 2009 La microbiologie prévisionnelle (ou
microbiologie prédictive)
http://www.alimentaire-pro.com/dossiers/microbiologie_aliments/microbiologie_previsionnelle.php

JEUDI 17 SEPTEMBRE 2009

AGRIWORLD - 2006 - Poultry pathogen models for predictive microbiology
http://www.agriworld.nl/public/file/pdf/20070302-20_ppm_food_safety.pdf

VENDREDI 19 MARS 2010

Nouveaux avis en ligne de l'AFSSA:
Avis du 12 octobre 2009 de l’Agence française de sécurité sanitaire des aliments
relatif à une demande d’appui scientifique et technique de l’outil prévisionnel
Sym’Previus version II
http://www.afssa.fr/Documents/MIC2009sa0033.pdf

MERCREDI 07 AVRIL 2010

International Conference on Predictive Modeling in Foods - Extended Abstracts 6th ICPMF
http://www.icpmf.org/Extended%20Abstracts%202009%20Final.pdf
Autres documents dans le même site:
http://www.google.fr/search?q=site%3Awww.icpmf.org&ie=utf-8&oe=utf-8&aq=t&client=firefox-a&rlz=

JEUDI 13 MAI 2010

Food Microbiology, In Press, Accepted Manuscript, Available online 10 May 2010
Challenges in risk assessment and predictive microbiology of foodborne spore-forming bacteria
http://www.sciencedirect.com/science/science?_ob=GatewayURL&_method=citationSearch&_urlVersion=4&_origin=SDSRCHALERTHTML&_version=1&_uoikey=B6WFP-5023KJ3-2&md5=60156041fb292d33e77d7efb281c65cd&graphAbs=y
a Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort, unité Microbiologie des Aliments – Sécurité et Qualité (MASQ), 7 avenue du Général de Gaulle, F-94704 Maisons-Alfort Cedex, France

DIMANCHE 23 MAI 2010

INRA TOULOUSE - 2009 - Vers une biologie et une écologie plus prédictives
http://www2.toulouse.inra.fr/ifr40/fr/actualites/Ch1_Vers%20une%20biologie%20et%20une%20ecologie%20plus%20predictives.pdf